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保有住现有的型体，分散成了‘群’，形成了星球上的霸主——人类。
而完成了孕育使命的生命之树也因为精华的耗尽，迅速枯萎，只留下一截残枝形成了拥有让所有使徒力量回归如初的朗基奴斯长枪。
然后消耗掉了一定力量的亚当和莉莉丝开始沉睡，任由新诞生的人类茫然的生活在那片蛮荒的世界上……直到1947年，一些吉普赛人偶然在约‘旦溪谷的洞窟中发现了死海文书，这才算是解开自身的诞生之迷。但也在同时，让人类知道了一个可怕的事实，那就是当某个时间到来时，亚当所生的使徒会回归‘白之月’，莉莉丝所生的使徒会回归‘黑之月’，重新生长出生命之树并产生新形态的生命体。
这也是亚当为什么会被称为第一使徒，莉莉丝被称为第二使徒的原因。
而其中若亚当的使徒率先回归，将引发撞击，作为代价，另一方的后代将获得死亡！反之若是另一方回归莉莉丝，也会成为新生命形态。尽管最后的结果也是死，但灵魂将得到拯救。因此在这个约定时刻到来之前。人类要想顺利完成回归，就必须在此之前消灭全部的使徒。
这才是人类必须要和使徒战斗的根本原因，为了活下去！
只不过在这过程中，一群宗‘教疯子却想要连最后一步也要进行下去，让全部的人类融合成一体，形成新的生命体——全灵，亦或者神，永恒的在宇宙中存活下去，用以来证明人类曾经存在过的痕迹，由此通过有着共同愿望的人建立了极机密组织seele。并制定出了所谓的‘人类补完计划’。
然而想要完好、顺利的实行‘人类补完计划’，那么作为第一使徒的亚当就必须要控制在自己的手里才行！所以为了这一目的，seele开始在全世界招收有才华的科学家。eva计划的重要参与者及设计人之一的碇唯，明日香的母亲、冬月副司令便是这个时候加入seele的。
同理的还有葛城美里的父亲，赤木律子的母亲等，只不过所负责的项目并不相同罢了。
而其中葛城美里的父亲，理论推倒出了s2机关存在形式的葛城博士所负责的就是亚当的胚胎化回归的内容。当然，是被隐藏和阉割过的版本，也因此。他才会稀里糊涂的将自家的女儿带到南极，并因为不知情的原因傻傻的引发了第二次冲击，葬身南极。
反到是同样知道这一计划，且还知道的很详细的碇元渡率先带着资料跑路了。直到第二次冲击过后，才重新以救援人员的身份返回南极，救下了被葛城博士拼死救下的葛城美里。
而这之后，亚当因为释放完体内积累的全部力量回归成了胚胎。被碇元渡收回。莉莉丝的身体被炸成了碎块，也被碇元渡和seele的人带走，只剩下朗基奴斯枪因为某些原因被滞留在了南极深海当中。
与此同时。除了亚当、莉莉丝外的全部使徒正式开始苏醒。存有亚当灵魂的诸熏诞生，并被seele找到。初号机被制造完成，碇唯以牺牲自己的方式把灵魂融进了利用莉莉丝的肉‘体复制出的初号机中，在想利用初号机的重要性阻止第三次冲击诞生的同时，作为eva永生下去，向宇宙的其他文明或未来生物证明人类曾经存在过的痕迹。
同时也因此，碇元渡制定出了人类补完计划二号，为再见碇唯一次而努力中……
用亚当的血肉制造的其他号数的eva被提上计划，开始制造。为此，明日香的母亲成了第二位牺牲者，被二号机吞噬了一半的灵魂，发疯。
利用莉莉丝的血肉精华混合碇唯残留的lcl物质中提取的信息代码的零波丽被制造成功，并通过早期的dummy system系统将莉莉丝的灵魂转移到了零波丽的体内。
当然，这里的零波丽是复数的。毕竟使徒的灵魂何等强大？可不是区区一具普通人的身体就能承受的。至于现在嘛，则因为初号机的渐渐觉醒——暴走，以及零波丽本身的人格诞生而变得能够承受，这也是周朝为何敢就那么销毁中‘央‘教条区的灵魂之间中的克隆零波丽的主要原因。
再然后，就是使徒来袭，nerv迎战，基本大家都知道的事情了。
……
“这些……都是真的？”听完赤木律子那开诚布公的详细陈述，葛城美里脸上的表情即愤怒又悲伤，语气很是复杂的轻声追问道。
“是的，一切都是真的。”赤木律子语气平淡的确认道。
“这，怎么可能！？”明日香双目发直，表现呆滞的喃喃自语道。显然，母亲被二号机吞噬一半灵魂的事情对她冲击很大。
不过想想也是，一直被当做重要工具的二号机中居然存在着自己的母亲的灵魂……这事放谁身上在知道后都不会好受。
“谢谢你告诉我这些，律子。”片刻后，葛城美里深吸口气，闭眼轻轻说道。然后骤然睁开眼睛，眼中满是杀气的咬牙切齿道“这样我就更应该留在这里了！seele那些家伙，居然敢这么利用爸爸……我是绝对不会放过他们的。”
“看来，我们要就此永别了。”赤木律子看了看葛城美里，摇头低声说道。
“如果你执意要找seele复仇的话。你可以联络一下加持良智，我想他应该愿意，也有能力帮助你。”一旁的周朝暗暗叹息一声，开口说道。
“我知道了。”葛城美里沉声说道。
“这些都不是真的！你们在骗人！骗子！”然后就在这时，一直在那里喃喃自语的明日香突然歇斯底里的大叫一声，转身朝指挥室外跑了出去。
“明日香！”被吓了一跳的葛城美里叫道。紧接着迈动脚步，就要去追明日香，但是还未等她彻底行动起来，奔跑向指挥室大门的明日香便突然闷哼一声，身体软软的摔倒在了地面上。
“扑通。”
而后周朝拿出物质数字化转换器。对着明日香按下了转换键。
霎时间白色的光芒在指挥室中亮起，将昏倒的明日香变做光子洪流，收进了物质数字化转换器中。
葛城美里见状张了张嘴，最后还是没有说出什么，默认了周朝的行为。
“既然你要留下来，那么这里原本的工作人员就也给你留下好了，不至于让你的反抗看起来那么凄惨。”收好了明日香的周朝转身面向葛城美里说道。
当然，这也就是这么一说，卖葛城美里人情而已。因为在周朝原本的计划中，就没打算带走那些家伙，要能力不如大唐世界的调整者，要才能也没有像赤木律子和伊吹摩耶这种得到赤木律子开小灶的人那么惊艳。最多也就是普普通通，只是单纯带回去组装eva的话，还不如周朝手里的骨架机器人来的效率。最多半个小时，就能从初学者成为技术高超的熟练工。绝对完爆这里的工作人员。
至于说他们手中掌握的技术什么的，有了赤木律子和magi在，周朝一点都不担心复制不出来。更何况，他的手里还有个玩生物改造技术同样不差的红后存在，推陈出新什么的一点都不是问题。
“那就多谢了。”葛城美里撇嘴道。
真想给我留班底，那你到是把magi留下啊！把它带走了，光留一帮人又能有多少用？再加上现在的烂摊子，到时候鬼知道还能留下多少人。
然后场面静默下来，只剩下高能聚束光束切割混凝土和金属的声音在指挥室中不停的回荡着。
如此半个多小时后……
就在这时，一阵急促的警报声在nerv基地中响彻了开来。
“怎么回事？”葛城美里下意识的问道。不过一问完，就马上想起现在可不是平时，没人会向她汇报外边到底发生了什么。
“是战自，他们的进攻到了，目前正在破坏外层的隔断装甲。”周朝伸手在虚空虚点了数下，随口回答道。顿了顿，又说道“他们来的到是时候。”
而几乎就在周朝话音落下的瞬间，贾维斯的声音便在他的耳边响了起来。
“先生，分拆完毕，您随时可以对magi进行收取了。”
“我知道了。”周朝说道。
“什么？”葛城美里莫名其妙的问道。
“你们三个先出去，我接收一下magi。”周朝道。
赤木律子微一点头，带着伊吹摩耶就出了指挥室，接着葛城美里也是一样。然后眼见平台上再无闲人的周朝也没罗嗦，直接身形一动，在超能力的加持下飘飞到指挥高台前方与大屏幕之间用来投射三维地型图的空间当中，转过身，面向指挥平台，取出物质�